Mikrobiota Usus: Lebih Daripada Sekadar Bakteria — Satu Pandangan Holistik dari Pengamal Sains Herba
Oleh: Lebah
Sebagai pengamal kesihatan holistik yang telah lama mengamalkan sains herba, saya melihat tubuh manusia sebagai suatu ekosistem yang dinamis. Ia bukan sekadar mesin yang perlu “dibaiki” apabila sesuatu bahagian rosak, tetapi suatu rangkaian kompleks yang melibatkan makanan, mikroorganisma, sistem imun dan otak yang saling berinteraksi setiap hari.
Perbincangan tentang mikrobiota usus besar memperlihatkan bahawa kita mungkin terlalu lama memberi tumpuan kepada bakteria sahaja, sedangkan ekosistem tersebut jauh lebih kaya dan dinamik. Untuk memahami mikrobiota secara lebih menyeluruh, kita perlu melihat bukan sahaja siapa yang hidup di dalamnya, tetapi juga bagaimana mikroorganisma tersebut berinteraksi antara satu sama lain dan dengan perumahnya.
Mikrobiota yang Dilupakan: Virus, Kulat dan Archaea
Bakteria mendominasi perbincangan tentang mikrobiota usus. Namun, ekosistem usus turut merangkumi komuniti lain, termasuk virom yang terdiri daripada virus seperti bakteriofaj, mikobiom yang merangkumi kulat seperti Candida dan Saccharomyces, serta arkea yang merangkumi organisma metanogen seperti Methanobrevibacter smithii. Komuniti ini masih kurang dikaji berbanding bakteria dan sebahagiannya digambarkan sebagai dark matter mikrobiom (Matijašić et al., 2020).
Jadual 1. Kumpulan mikroorganisma dan unsur biologi yang berkaitan dengan ekosistem usus manusia
| Komponen | Contoh atau kumpulan | Ciri dan peranan utama |
| Bakteria | Bacillota (dahulunya Firmicutes), Bacteroidota (dahulunya Bacteroidetes), Actinobacteriota | Kumpulan utama mikroorganisma selular dalam kajian mikrobiota usus. Terlibat dalam fermentasi substrat makanan, penghasilan metabolit dan interaksi dengan sistem imun. Sesetengah spesies boleh membentuk endospora. |
| Virus dan bakteriofaj | Bakteriofaj yang menjangkiti bakteria usus | Virom merangkumi komuniti virus dalam sesuatu persekitaran. Bakteriofaj boleh mempengaruhi populasi bakteria dan dinamik komuniti mikrob. |
| Kulat | Candida, Saccharomyces | Komponen mikobiom usus yang kelimpahannya berbeza antara individu. Boleh berinteraksi dengan mikroorganisma lain dan sistem imun perumah. |
| Arkea | Methanobrevibacter smithii | Organisma selular daripada domain Archaea. Arkea metanogen tertentu menggunakan hidrogen dan menghasilkan metana, sekali gus mempengaruhi interaksi metabolik dalam komuniti mikrob. |
| Prophage | Bahan genetik bakteriofaj dalam bakteria semasa keadaan lisogenik | Bukan kumpulan mikroorganisma yang berasingan. Prophage boleh kekal dalam genom bakteria dan, dalam keadaan tertentu, mengalami induksi. |
| Endospora bakteria | Spora yang dibentuk oleh bakteria tertentu | Struktur tahan lasak yang membantu bakteria tertentu bertahan dalam keadaan persekitaran yang tidak sesuai. Endospora boleh kembali kepada keadaan vegetatif melalui proses germinasi apabila keadaan mengizinkan. |
Setiap komponen ini mempunyai ciri biologi yang berbeza. Bakteriofaj boleh mengubah populasi bakteria melalui jangkitan dan lisis sel perumah, manakala kulat boleh berinteraksi dengan sistem imun melalui komponen dinding selnya. Sesetengah arkea pula menggunakan hidrogen yang terhasil daripada fermentasi bakteria. Oleh itu, memahami mikrobiota hanya melalui bakteria memberikan gambaran yang tidak lengkap tentang interaksi dalam ekosistem usus (Richard & Sokol, 2019; Shkoporov & Hill, 2019; Gaci et al., 2014).
Satu lagi ciri penting ialah keupayaan sesetengah mikroorganisma untuk memasuki keadaan tidak aktif. Banyak bakteria pembentuk endospora, termasuk sesetengah ahli Bacillota, mampu menghasilkan struktur tahan lasak yang boleh bertahan dalam keadaan tertentu sebelum kembali aktif melalui germinasi. Penyelidikan terhadap mikrobiota manusia turut menunjukkan bahawa keupayaan membentuk spora merupakan ciri penting bagi sebahagian bakteria usus (Browne et al., 2016).
Begitu juga, prophage boleh kekal dalam genom bakteria semasa keadaan lisogenik dan mengalami induksi dalam keadaan tertentu. Walaupun pembentukan endospora dan lisogeni merupakan fenomena biologi yang berbeza, kedua-duanya menunjukkan bahawa aktiviti mikroorganisma tidak semestinya dapat difahami hanya melalui pengukuran kelimpahan atau kehadiran mikroorganisma pada satu-satu masa. Walau bagaimanapun, fenomena ini sahaja tidak membuktikan daya tahan keseluruhan ekosistem mikrobiota.
Dari sudut sains herba, persoalan yang wajar dikaji ialah sama ada intervensi diet atau tumbuhan ubatan mempengaruhi bukan sahaja pertumbuhan dan kelimpahan mikroorganisma, tetapi juga keadaan fisiologi atau aktiviti kumpulan mikroorganisma tertentu, termasuk yang berada dalam keadaan tidak aktif. Ini merupakan hipotesis penyelidikan, bukannya kesimpulan yang telah dibuktikan secara umum. Pengujiannya memerlukan kaedah yang dapat membezakan perubahan kelimpahan mikroorganisma daripada perubahan aktiviti atau keadaan fisiologinya.
Makanan Harian sebagai Arkitek Ekologi Usus
Diet merupakan salah satu faktor utama yang membentuk komposisi dan fungsi mikrobiota usus. Serat makanan dan kanji rintang (resistant starch) daripada tumbuhan menyediakan substrat kepada bakteria yang menghasilkan asid lemak rantaian pendek (short-chain fatty acids, SCFA), termasuk bakteria daripada genus seperti Faecalibacterium dan Roseburia. SCFA, khususnya butirat, mempunyai peranan penting dalam fisiologi usus, termasuk menyokong fungsi sawar epitelium dan mempengaruhi tindak balas imun serta metabolisme perumah (Koh et al., 2016).
Hubungan antara usus dan otak juga semakin mendapat perhatian. Kajian menunjukkan bahawa mikrobiota usus boleh mempengaruhi biosintesis serotonin periferi melalui interaksi dengan sel enterochromaffin. Yano et al. (2015), misalnya, menunjukkan bahawa bakteria tertentu daripada mikrobiota usus boleh memodulasi penghasilan serotonin oleh sel enterochromaffin.
Oleh itu, ungkapan “usus ialah otak kedua” boleh menjadi metafora yang berguna, tetapi hubungan sebenar antara kedua-duanya jauh lebih kompleks. Paksi usus–otak melibatkan sistem saraf, sistem imun, metabolit mikrob dan laluan biologi lain yang saling berinteraksi. Hubungan tersebut tidak bermakna bahawa satu makanan atau satu perubahan mikrobiota secara langsung menentukan mood, fokus atau kognisi seseorang.
Diet Tradisional: Tiada Satu Formula Sejagat
Corak pemakanan tradisional berbeza mengikut persekitaran, sumber makanan, budaya dan sejarah setiap populasi. Kepelbagaian ini penting dalam memahami hubungan antara diet dengan mikrobiota usus, kerana komuniti mikroorganisma turut dipengaruhi oleh konteks kehidupan perumahnya.
Kajian terhadap komuniti Inuit di Artik, misalnya, menunjukkan ciri mikrobiom usus yang tersendiri dalam konteks diet dan persekitaran kehidupan mereka (Girard et al., 2017). Dapatan ini mengingatkan kita bahawa hubungan antara pemakanan dengan mikrobiota perlu ditafsirkan dengan mengambil kira latar ekologi dan sejarah populasi, bukan berdasarkan diet semata-mata.
Begitu juga, kajian terhadap komuniti luar bandar Papua New Guinea mendapati perbezaan dalam komposisi mikrobiota berbanding populasi yang lebih terindustrialisasi (Martínez et al., 2015). Perbezaan sedemikian membuka ruang untuk mengkaji pengaruh pemakanan, persekitaran dan gaya hidup terhadap ekologi mikrobiota, walaupun sumbangan relatif setiap faktor perlu dinilai secara berasingan.
Diet Mediterranean tradisional pula banyak menekankan sayur-sayuran, buah-buahan, kekacang, bijirin penuh dan minyak zaitun, dengan ikan sebagai salah satu sumber protein. Kajian tentang corak pemakanan ini turut meneliti kaitannya dengan komposisi mikrobiota dan mikroorganisma yang terlibat dalam penghasilan metabolit seperti asid lemak rantaian pendek (SCFA) (Gundogdu & Nalbantoglu, 2023; Nagpal et al., 2024). Walau bagaimanapun, hasil kajian perlu ditafsirkan berdasarkan reka bentuk penyelidikan dan bukti khusus yang dikemukakan oleh setiap sumber.
Diet tradisional Okinawa pula lazimnya merangkumi ubi keledek, sayur-sayuran, soya dan pelbagai makanan berasaskan tumbuhan. Corak ini boleh dijadikan contoh kepelbagaian tradisi pemakanan, tetapi penerangan tentang diet Okinawa tidak dengan sendirinya membuktikan kesan tertentu terhadap mikrobiota usus. Dakwaan sedemikian memerlukan sokongan daripada kajian yang mengukur mikrobiota secara langsung.
Secara lebih luas, peralihan daripada corak pemakanan tradisional kepada pengambilan makanan yang sangat diproses sering dikaji dalam kaitannya dengan perubahan mikrobiota dan risiko penyakit metabolik. Namun, hubungan yang diperhatikan tidak bermakna semua makanan tradisional semestinya sihat, atau semua corak pemakanan moden memberikan kesan yang sama.
Kesimpulannya, contoh-contoh ini tidak bertujuan menentukan populasi yang mempunyai “diet terbaik”. Sebaliknya, contoh tersebut menekankan bahawa hubungan antara diet, persekitaran, faktor biologi perumah dan mikrobiota perlu difahami secara kontekstual. Pendekatan holistik bukanlah mencari satu formula pemakanan universal, tetapi meneliti bagaimana faktor-faktor ini saling berinteraksi.
Autism, ADHD dan Dyspraxia: Antara Pemerhatian dan Hipotesis Pemakanan
Dalam amalan klinikal dan wacana pemakanan komplementari, terdapat pengamal yang menekankan pengambilan makanan yang mencukupi dari segi protein dan lemak, di samping mengurangkan makanan yang sangat diproses. Pendekatan seperti ini turut digunakan dalam sesetengah perbincangan mengenai autism, ADHD dan dyspraxia.
Salah seorang tokoh yang paling dikenali dalam bidang ini ialah Dr. Natasha Campbell-McBride, yang memperkenalkan pendekatan Gut and Psychology Syndrome (GAPS). Buku beliau, Gut and Psychology Syndrome, dibangunkan berdasarkan pengalaman klinikal serta pengalaman peribadi beliau berkaitan anaknya yang didiagnosis dengan autism (Campbell-McBride, 2010).
Pendekatan GAPS memberikan penekanan kepada makanan yang dianggap lebih mudah diterima oleh sistem pencernaan, pemakanan yang padat nutrien serta pengurangan makanan tertentu yang dianggap boleh mengganggu fungsi usus. Dari perspektif hipotesis, pendekatan tersebut selari dengan minat yang semakin meningkat terhadap hubungan antara usus, sistem imun, metabolisme dan otak.
Namun, penting untuk membezakan antara pengalaman klinikal, laporan anekdot dan bukti klinikal terkawal. Pemerhatian bahawa seseorang mengalami perubahan selepas mengubah diet tidak dengan sendirinya membuktikan bahawa diet tersebut berkesan untuk autism, ADHD atau dyspraxia.
Dari sudut biologi, terdapat beberapa mekanisme yang menarik untuk dikaji. Protein membekalkan asid amino yang menjadi prekursor kepada pelbagai molekul isyarat, manakala perubahan dalam pengambilan makanan yang terlampau diproses boleh mempengaruhi metabolisme secara lebih luas. Interaksi antara diet, mikrobiota, sistem imun dan paksi usus–otak juga merupakan bidang penyelidikan yang aktif.
Namun, mekanisme yang munasabah secara biologi tidak semestinya membuktikan keberkesanan klinikal. Respons individu juga boleh berbeza mengikut corak pemakanan sedia ada, keperluan nutrien, pilihan makanan yang terhad (selective eating) dan komposisi mikrobiota masing-masing.
Oleh itu, pendekatan pemakanan seperti GAPS lebih wajar dibincangkan sebagai pendekatan komplementari atau hipotesis pemakanan yang memerlukan penilaian bukti, bukannya sebagai pengganti terapi tingkah laku, intervensi pendidikan atau sokongan klinikal yang sesuai.
Herba sebagai Pengubah Ekologi, Bukan Sekadar Antimikrob
Tumbuhan ubatan bukan sekadar sumber agen antimikrob. Tumbuhan juga mengandungi polifenol dan pelbagai sebatian bioaktif yang berpotensi mempengaruhi ekosistem mikrobiota usus. Sesetengah komponen tumbuhan, termasuk serat tertentu yang boleh dimanfaatkan oleh mikroorganisma, turut berpotensi menyokong penghasilan metabolit mikrob yang berkaitan dengan fungsi usus.
Oleh itu, persoalannya bukan hanya sama ada sesuatu herba dapat menghalang atau membunuh mikroorganisma tertentu, tetapi juga bagaimana komponennya berinteraksi dengan komuniti mikrobiota yang sedia ada. Bergantung pada jenis sebatian dan keadaan persekitaran, interaksi ini berpotensi mempengaruhi pertumbuhan mikroorganisma tertentu, penghasilan metabolit serta hubungan antara anggota komuniti tersebut.
Satu lagi persoalan yang masih memerlukan penyelidikan ialah kemungkinan sebatian tumbuhan mempengaruhi interaksi antara bakteria dengan bakteriofaj, termasuk proses induksi prophage, atau mempengaruhi germinasi spora bakteria. Kedua-dua proses ini berbeza dari segi mekanisme biologi. Setakat yang dapat disimpulkan daripada perbincangan ini, kesan herba tertentu terhadap proses tersebut dalam ekosistem usus manusia belum boleh dianggap terbukti.
Dari sudut sains herba, penilaian terhadap sesuatu intervensi tidak seharusnya bergantung pada label “mikroorganisma baik” atau “mikroorganisma jahat” semata-mata. Walaupun sesetengah mikroorganisma boleh memberi manfaat dan yang lain boleh menyebabkan penyakit, kesan sesuatu intervensi terhadap kesihatan usus turut bergantung pada interaksi antara mikroorganisma, persekitarannya dan fungsi ekosistem secara keseluruhan. Oleh itu, potensi herba perlu dinilai berdasarkan kesan yang dapat dibuktikan, bukan hanya berdasarkan aktiviti antimikrob atau andaian bahawa perubahan komposisi mikrobiota semestinya membawa manfaat.
Penutup: Memahami Ekologi Usus secara Holistik
Mikrobiota usus mengingatkan kita bahawa kesihatan tidak boleh difahami melalui satu jenis mikroorganisma sahaja. Bakteria, virus, bakteriofaj, kulat dan archaea merupakan sebahagian daripada ekosistem usus yang berinteraksi dengan perumahnya. Hubungan antara mereka, bersama keadaan persekitaran usus, turut mempengaruhi fungsi ekosistem tersebut.
Dalam konteks ini, pemakanan bukan sekadar membekalkan tenaga dan nutrien kepada manusia. Makanan juga menyediakan substrat yang boleh dimanfaatkan oleh mikroorganisma, sekali gus mempengaruhi aktiviti dan komposisi komuniti mikrob. Kepelbagaian tradisi pemakanan, daripada Mediterranean dan Okinawa hingga komuniti Artik, Pasifik dan Hunza, mengingatkan kita bahawa tiada satu corak pemakanan yang wajar dianggap sebagai formula universal tanpa mengambil kira konteks budaya, persekitaran dan biologi.
Prinsip yang sama relevan dalam sains herba. Daripada menilai tumbuhan ubatan hanya berdasarkan keupayaannya menghalang atau membunuh mikroorganisma tertentu, kita juga perlu meneliti bagaimana sebatian tumbuhan berinteraksi dengan mikrobiota dan mempengaruhi fungsi ekosistem usus. Namun, kemungkinan mekanisme biologi tidak semestinya membuktikan manfaat klinikal; setiap dakwaan perlu dinilai berdasarkan bukti yang sesuai.
Di sinilah nilai sebenar pendekatan holistik: bukan sekadar memperluas skop pemerhatian, tetapi memahami hubungan antara pelbagai komponen tanpa mengabaikan ketelitian saintifik. Kita perlu membezakan antara penemuan yang telah disokong oleh bukti, pemerhatian yang masih memerlukan pengesahan dan hipotesis yang menunggu pengujian.
Akhirnya, memahami kesihatan usus menuntut kita melihat lebih daripada mikroorganisma secara berasingan. Kita perlu memahami hubungan antara mikrobiota, pemakanan, perumah dan persekitarannya. Bagi sains herba, perspektif ini membuka ruang penyelidikan yang lebih luas—bukan dengan menganggap semua kemungkinan sebagai fakta, tetapi dengan mengemukakan soalan yang tepat dan mengujinya secara sistematik.
Rujukan
Browne, H. P., Forster, S. C., Anonye, B. O., Kumar, N., Neville, B. A., Stares, M. D., Goulding, D., & Lawley, T. D. (2016). Culturing of ‘unculturable’ human microbiota reveals novel taxa and extensive sporulation. Nature, 533(7604), 543–546. https://doi.org/10.1038/nature17645
Campbell-McBride, N. (2010). Gut and psychology syndrome: Natural treatment for autism, dyspraxia, A.D.D., dyslexia, A.D.H.D., depression, schizophrenia (2nd ed.). Medinform Publishing.
Gaci, N., Borrel, G., Tottey, W., O’Toole, P. W., & Brugère, J.-F. (2014). Archaea and the human gut: New beginning of an old story. World Journal of Gastroenterology, 20(43), 16062–16078. https://doi.org/10.3748/wjg.v20.i43.16062
Girard, C., Tromas, N., Amyot, M., & Shapiro, B. J. (2017). Gut microbiome of the Canadian Arctic Inuit. mSphere, 2(1), e00297-16. https://doi.org/10.1128/mSphere.00297-16
Gundogdu, A., & Nalbantoglu, O. U. (2023). The role of the Mediterranean diet in modulating the gut microbiome: A review of current evidence. Nutrition, 114, 112118. https://doi.org/10.1016/j.nut.2023.112118
Koh, A., De Vadder, F., Kovatcheva-Datchary, P., & Bäckhed, F. (2016). From dietary fiber to host physiology: Short-chain fatty acids as key bacterial metabolites. Cell, 165(6), 1332–1345. https://doi.org/10.1016/j.cell.2016.05.041
Martínez, I., Stegen, J. C., Maldonado-Gómez, M. X., Eren, A. M., Siba, P. M., Greenhill, A. R., & Walter, J. (2015). The gut microbiota of rural Papua New Guineans: Composition, diversity patterns, and ecological processes. Cell Reports, 11(4), 527–538. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2015.03.049
Matijašić, M., Meštrović, T., Paljetak, H. Č., Perić, M., Barešić, A., & Verbanac, D. (2020). Gut microbiota beyond bacteria—Mycobiome, virome, archaeome, and eukaryotic parasites in IBD. International Journal of Molecular Sciences, 21(8), 2668. https://doi.org/10.3390/ijms21082668
Nagpal, R., Shively, C. A., Appt, S. A., Register, T. C., Michalson, K. T., Vitolins, M. Z., & Yadav, H. (2024). Adherence to the Mediterranean diet can beneficially affect the gut microbiota composition: A systematic review. BMC Medical Genomics, 17, Article 86. https://doi.org/10.1186/s12920-024-01861-3
Richard, M. L., & Sokol, H. (2019). The gut mycobiota: Insights into analysis, environmental interactions and role in gastrointestinal diseases. Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 16, 331–345. https://doi.org/10.1038/s41575-019-0121-2
Shkoporov, A. N., & Hill, C. (2019). Bacteriophages of the human gut: The “known unknown” of the microbiome. Cell Host & Microbe, 25(2), 195–209. https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.01.017
Willcox, D. C., Willcox, B. J., & Suzuki, M. (2024). Why the traditional Okinawan diet is the recipe for a long life. National Geographic. https://www.nationalgeographic.com/science/article/okinawa-diet-benefits-blue-zones
Yano, J. M., Yu, K., Donaldson, G. P., Shastri, G. G., Ann, P., Ma, L., Nagler, C. R., Ismagilov, R. F., Mazmanian, S. K., & Hsiao, E. Y. (2015). Indigenous bacteria from the gut microbiota regulate host serotonin biosynthesis. Cell, 161(2), 264–276. https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.02.047
Copyright © 2026 www.gayahidupholistik.blogspot.com All Rights Reserved.
